また新しいPCを買ったときに同じことをせねばならないのは間違いないので大体の流れをメモ
ここではwindows7→windows10ですが、たぶんバージョンには依らないと思う…
できるだけ同じcygwin環境を作ることが目的

まずcygwin64のフォルダをwindows標準圧縮（右クリック→送る）
USBに移してwindows10の方へコピー
前のと同じドライブ（ここではCドライブ）にコピーして全て展開

最初重過ぎて（？）応答なしになるものの、しばらく待つと展開が始まります

しかし全然展開が終わらず軽く3時間経過してしまった…とりあえず帰宅

翌朝終了していたが、展開場所が\c\cygwin64\cygwin64となってしまっていたので全体を上に移動
しかし\libフォルダだけ使用中で移動できなかったので一旦再起動、\libフォルダも移動

cygwin.batファイルへのショートカットをデスクトップに作成してcygwin起動、がしかしユーザー名を変えていたので別ユーザーのフォルダが作成されてしまう
とりあえず以前のフォルダから新しいほうへ丸々コピー

あとは.bashrcの中のユーザー名とか細かい設定を直せばOK